Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1cQ6PDZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1cQ6PDZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf1cQ6PDZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Taf1cQ6PDZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1cQ6PDZ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Taf1cQ6PDZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1cQ6PDZ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1cQ6PDZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms