Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trak2Q6P9N8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak2Q6P9N8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak2Q6P9N8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak2Q6P9N8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak2Q6P9N8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trak2Q6P9N8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms