Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Slx4Q6P1D7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Slx4Q6P1D7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Slx4Q6P1D7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Slx4Q6P1D7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Slx4Q6P1D7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Slx4Q6P1D7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Slx4Q6P1D7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Slx4Q6P1D7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Slx4Q6P1D7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Slx4Q6P1D7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Slx4Q6P1D7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Slx4Q6P1D7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Slx4Q6P1D7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Slx4Q6P1D7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Slx4Q6P1D7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Slx4Q6P1D7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Slx4Q6P1D7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Slx4Q6P1D7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Slx4Q6P1D7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Slx4Q6P1D7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Slx4Q6P1D7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Slx4Q6P1D7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Slx4Q6P1D7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Slx4Q6P1D7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Slx4Q6P1D7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Slx4Q6P1D7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Slx4Q6P1D7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Slx4Q6P1D7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.3 ms