Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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