Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cep290Q6A078 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep290Q6A078 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep290Q6A078 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep290Q6A078 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep290Q6A078 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep290Q6A078 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep290Q6A078 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep290Q6A078 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep290Q6A078 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cep290Q6A078 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep290Q6A078 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms