Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptbn2Q68FG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn2Q68FG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn2Q68FG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn2Q68FG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sptbn2Q68FG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn2Q68FG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn2Q68FG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms