Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha6Q62413 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha6Q62413 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha6Q62413 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha6Q62413 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha6Q62413 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha6Q62413 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha6Q62413 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha6Q62413 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms