Protein–RNA interactions for Protein: Q62168

Krt32, Keratin, type I cuticular Ha2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt32Q62168 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt32Q62168 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt32Q62168 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt32Q62168 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt32Q62168 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt32Q62168 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt32Q62168 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt32Q62168 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt32Q62168 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt32Q62168 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt32Q62168 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms