Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lama3Q61789 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lama3Q61789 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lama3Q61789 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lama3Q61789 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lama3Q61789 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lama3Q61789 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lama3Q61789 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama3Q61789 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama3Q61789 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lama3Q61789 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama3Q61789 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lama3Q61789 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lama3Q61789 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lama3Q61789 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama3Q61789 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lama3Q61789 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lama3Q61789 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lama3Q61789 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama3Q61789 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama3Q61789 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama3Q61789 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama3Q61789 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms