Protein–RNA interactions for Protein: Q61575

Foxn1, Forkhead box protein N1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn1Q61575 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Foxn1Q61575 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Foxn1Q61575 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Foxn1Q61575 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Foxn1Q61575 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Foxn1Q61575 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Foxn1Q61575 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Foxn1Q61575 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Foxn1Q61575 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Foxn1Q61575 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Foxn1Q61575 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Foxn1Q61575 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Foxn1Q61575 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Foxn1Q61575 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Foxn1Q61575 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms