Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd55bQ61476 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd55bQ61476 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd55bQ61476 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd55bQ61476 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd55bQ61476 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd55bQ61476 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd55bQ61476 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms