Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha2Q60716 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha2Q60716 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha2Q60716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha2Q60716 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P4ha2Q60716 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P4ha2Q60716 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P4ha2Q60716 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P4ha2Q60716 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms