Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm6bQ5NCY0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Kdm6bQ5NCY0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm6bQ5NCY0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Kdm6bQ5NCY0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm6bQ5NCY0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm6bQ5NCY0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm6bQ5NCY0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kdm6bQ5NCY0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kdm6bQ5NCY0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm6bQ5NCY0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm6bQ5NCY0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm6bQ5NCY0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm6bQ5NCY0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm6bQ5NCY0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm6bQ5NCY0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm6bQ5NCY0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm6bQ5NCY0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm6bQ5NCY0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm6bQ5NCY0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm6bQ5NCY0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm6bQ5NCY0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm6bQ5NCY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Kdm6bQ5NCY0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm6bQ5NCY0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms