Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Neurl4Q5NCX5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Neurl4Q5NCX5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Neurl4Q5NCX5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Neurl4Q5NCX5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Neurl4Q5NCX5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Neurl4Q5NCX5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Neurl4Q5NCX5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Neurl4Q5NCX5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Neurl4Q5NCX5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Neurl4Q5NCX5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Neurl4Q5NCX5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Neurl4Q5NCX5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Neurl4Q5NCX5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Neurl4Q5NCX5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Neurl4Q5NCX5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Neurl4Q5NCX5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Neurl4Q5NCX5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Neurl4Q5NCX5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Neurl4Q5NCX5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Neurl4Q5NCX5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Neurl4Q5NCX5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Neurl4Q5NCX5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Neurl4Q5NCX5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Neurl4Q5NCX5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Neurl4Q5NCX5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Neurl4Q5NCX5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Neurl4Q5NCX5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Neurl4Q5NCX5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neurl4Q5NCX5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Neurl4Q5NCX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Neurl4Q5NCX5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms