Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Srrm1Q52KI8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Srrm1Q52KI8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Srrm1Q52KI8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Srrm1Q52KI8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srrm1Q52KI8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srrm1Q52KI8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srrm1Q52KI8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srrm1Q52KI8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srrm1Q52KI8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srrm1Q52KI8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srrm1Q52KI8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms