Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrfip1Q3UZ39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrfip1Q3UZ39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrfip1Q3UZ39 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrfip1Q3UZ39 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms