Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ankrd13cQ3UX43 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ankrd13cQ3UX43 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ankrd13cQ3UX43 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ankrd13cQ3UX43 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ankrd13cQ3UX43 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ankrd13cQ3UX43 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ankrd13cQ3UX43 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ankrd13cQ3UX43 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ankrd13cQ3UX43 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms