Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkain3Q3URJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkain3Q3URJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkain3Q3URJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkain3Q3URJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkain3Q3URJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain3Q3URJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkain3Q3URJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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