Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3N0

Mier2, Mesoderm induction early response protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier2Q3U3N0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mier2Q3U3N0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mier2Q3U3N0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier2Q3U3N0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier2Q3U3N0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mier2Q3U3N0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mier2Q3U3N0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mier2Q3U3N0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mier2Q3U3N0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mier2Q3U3N0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms