Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prok1Q14A28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prok1Q14A28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prok1Q14A28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prok1Q14A28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prok1Q14A28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prok1Q14A28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prok1Q14A28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prok1Q14A28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.7 ms