Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1700013D24RikQ0P521 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700013D24RikQ0P521 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
1700013D24RikQ0P521 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
1700013D24RikQ0P521 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
1700013D24RikQ0P521 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
1700013D24RikQ0P521 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
1700013D24RikQ0P521 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
1700013D24RikQ0P521 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
1700013D24RikQ0P521 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
1700013D24RikQ0P521 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
1700013D24RikQ0P521 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700013D24RikQ0P521 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms