Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cass4Q08EC4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cass4Q08EC4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cass4Q08EC4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cass4Q08EC4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cass4Q08EC4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cass4Q08EC4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cass4Q08EC4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms