Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sox12Q04890 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sox12Q04890 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sox12Q04890 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sox12Q04890 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sox12Q04890 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Sox12Q04890 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sox12Q04890 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sox12Q04890 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sox12Q04890 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sox12Q04890 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sox12Q04890 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sox12Q04890 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sox12Q04890 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sox12Q04890 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sox12Q04890 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sox12Q04890 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Sox12Q04890 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sox12Q04890 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Sox12Q04890 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.79■■■■□ 3
Sox12Q04890 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Sox12Q04890 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Sox12Q04890 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox12Q04890 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms