Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Grin2cQ01098 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Grin2cQ01098 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin2cQ01098 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2cQ01098 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2cQ01098 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grin2cQ01098 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2cQ01098 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms