Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax8Q00288 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pax8Q00288 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax8Q00288 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax8Q00288 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax8Q00288 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax8Q00288 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax8Q00288 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pax8Q00288 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax8Q00288 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax8Q00288 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax8Q00288 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pax8Q00288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax8Q00288 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax8Q00288 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax8Q00288 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax8Q00288 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax8Q00288 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms