Protein–RNA interactions for Protein: P70460

Vasp, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VaspP70460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VaspP70460 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VaspP70460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VaspP70460 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VaspP70460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VaspP70460 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VaspP70460 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VaspP70460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VaspP70460 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VaspP70460 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VaspP70460 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VaspP70460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VaspP70460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VaspP70460 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VaspP70460 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VaspP70460 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VaspP70460 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VaspP70460 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VaspP70460 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VaspP70460 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VaspP70460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VaspP70460 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VaspP70460 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VaspP70460 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VaspP70460 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VaspP70460 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VaspP70460 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VaspP70460 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VaspP70460 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VaspP70460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VaspP70460 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VaspP70460 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VaspP70460 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VaspP70460 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VaspP70460 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VaspP70460 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VaspP70460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VaspP70460 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VaspP70460 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VaspP70460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VaspP70460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VaspP70460 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VaspP70460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VaspP70460 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VaspP70460 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VaspP70460 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VaspP70460 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VaspP70460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VaspP70460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VaspP70460 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VaspP70460 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VaspP70460 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VaspP70460 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VaspP70460 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VaspP70460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VaspP70460 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VaspP70460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VaspP70460 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VaspP70460 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VaspP70460 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VaspP70460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VaspP70460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VaspP70460 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VaspP70460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VaspP70460 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VaspP70460 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VaspP70460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VaspP70460 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VaspP70460 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VaspP70460 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VaspP70460 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VaspP70460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VaspP70460 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VaspP70460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VaspP70460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VaspP70460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VaspP70460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VaspP70460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VaspP70460 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VaspP70460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VaspP70460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VaspP70460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VaspP70460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VaspP70460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VaspP70460 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VaspP70460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VaspP70460 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VaspP70460 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VaspP70460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VaspP70460 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VaspP70460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VaspP70460 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VaspP70460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VaspP70460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VaspP70460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VaspP70460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VaspP70460 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VaspP70460 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VaspP70460 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VaspP70460 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms