Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgf11P70378 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fgf11P70378 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgf11P70378 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgf11P70378 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgf11P70378 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgf11P70378 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms