Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Cux2P70298 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Cux2P70298 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cux2P70298 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Cux2P70298 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Cux2P70298 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Cux2P70298 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Cux2P70298 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Cux2P70298 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Cux2P70298 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Cux2P70298 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Cux2P70298 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Cux2P70298 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Cux2P70298 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Cux2P70298 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Cux2P70298 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Cux2P70298 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Cux2P70298 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Cux2P70298 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Cux2P70298 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Cux2P70298 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Cux2P70298 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Cux2P70298 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Cux2P70298 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Cux2P70298 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Cux2P70298 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Cux2P70298 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cux2P70298 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Cux2P70298 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Cux2P70298 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Cux2P70298 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Cux2P70298 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Cux2P70298 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Cux2P70298 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Cux2P70298 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Cux2P70298 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Cux2P70298 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.35
Cux2P70298 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Cux2P70298 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Cux2P70298 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Cux2P70298 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Cux2P70298 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Cux2P70298 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Cux2P70298 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms