Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Wdhd1P59328 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Wdhd1P59328 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Wdhd1P59328 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Wdhd1P59328 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Wdhd1P59328 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Wdhd1P59328 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Wdhd1P59328 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Wdhd1P59328 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Wdhd1P59328 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Wdhd1P59328 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms