Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PolgP54099 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PolgP54099 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolgP54099 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolgP54099 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolgP54099 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolgP54099 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolgP54099 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolgP54099 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolgP54099 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PolgP54099 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PolgP54099 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PolgP54099 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PolgP54099 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PolgP54099 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PolgP54099 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PolgP54099 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PolgP54099 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PolgP54099 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolgP54099 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PolgP54099 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolgP54099 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolgP54099 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolgP54099 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PolgP54099 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PolgP54099 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PolgP54099 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PolgP54099 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolgP54099 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolgP54099 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolgP54099 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolgP54099 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolgP54099 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolgP54099 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolgP54099 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolgP54099 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolgP54099 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PolgP54099 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PolgP54099 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PolgP54099 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PolgP54099 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolgP54099 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolgP54099 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolgP54099 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PolgP54099 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PolgP54099 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PolgP54099 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolgP54099 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolgP54099 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolgP54099 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolgP54099 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PolgP54099 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolgP54099 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolgP54099 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolgP54099 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolgP54099 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolgP54099 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolgP54099 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolgP54099 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolgP54099 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolgP54099 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PolgP54099 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PolgP54099 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PolgP54099 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PolgP54099 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PolgP54099 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PolgP54099 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolgP54099 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolgP54099 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PolgP54099 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PolgP54099 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PolgP54099 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolgP54099 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PolgP54099 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PolgP54099 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PolgP54099 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolgP54099 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolgP54099 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PolgP54099 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PolgP54099 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolgP54099 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolgP54099 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolgP54099 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolgP54099 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolgP54099 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PolgP54099 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PolgP54099 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PolgP54099 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PolgP54099 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PolgP54099 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1575.2 ms