Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccr7P47774 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccr7P47774 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccr7P47774 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccr7P47774 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccr7P47774 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccr7P47774 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccr7P47774 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccr7P47774 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms