Protein–RNA interactions for Protein: P33434

Mmp2, 72 kDa type IV collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp2P33434 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp2P33434 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp2P33434 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp2P33434 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp2P33434 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp2P33434 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp2P33434 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp2P33434 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp2P33434 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp2P33434 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp2P33434 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp2P33434 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms