Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprmP28828 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprmP28828 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprmP28828 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PtprmP28828 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PtprmP28828 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PtprmP28828 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PtprmP28828 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PtprmP28828 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PtprmP28828 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PtprmP28828 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PtprmP28828 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PtprmP28828 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PtprmP28828 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PtprmP28828 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PtprmP28828 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PtprmP28828 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PtprmP28828 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PtprmP28828 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PtprmP28828 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PtprmP28828 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PtprmP28828 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PtprmP28828 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PtprmP28828 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprmP28828 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtprmP28828 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprmP28828 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PtprmP28828 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprmP28828 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms