Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou3f1P21952 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou3f1P21952 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou3f1P21952 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou3f1P21952 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou3f1P21952 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f1P21952 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms