Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnp2P11378 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnp2P11378 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnp2P11378 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnp2P11378 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnp2P11378 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnp2P11378 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnp2P11378 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnp2P11378 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnp2P11378 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnp2P11378 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnp2P11378 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms