Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prf1P10820 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prf1P10820 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prf1P10820 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prf1P10820 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prf1P10820 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prf1P10820 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prf1P10820 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prf1P10820 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prf1P10820 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prf1P10820 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prf1P10820 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prf1P10820 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prf1P10820 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prf1P10820 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prf1P10820 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prf1P10820 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prf1P10820 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prf1P10820 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prf1P10820 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prf1P10820 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prf1P10820 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms