Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3aO88508 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnmt3aO88508 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3aO88508 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt3aO88508 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3aO88508 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3aO88508 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt3aO88508 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms