Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfil3O08750 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nfil3O08750 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nfil3O08750 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfil3O08750 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nfil3O08750 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nfil3O08750 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfil3O08750 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfil3O08750 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfil3O08750 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfil3O08750 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nfil3O08750 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nfil3O08750 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nfil3O08750 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nfil3O08750 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms