Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn5O08688 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn5O08688 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn5O08688 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn5O08688 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn5O08688 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn5O08688 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn5O08688 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn5O08688 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn5O08688 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn5O08688 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn5O08688 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn5O08688 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn5O08688 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn5O08688 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn5O08688 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn5O08688 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn5O08688 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn5O08688 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn5O08688 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn5O08688 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn5O08688 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms