Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DspE9Q557 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DspE9Q557 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DspE9Q557 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DspE9Q557 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DspE9Q557 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DspE9Q557 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DspE9Q557 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DspE9Q557 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DspE9Q557 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DspE9Q557 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DspE9Q557 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DspE9Q557 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DspE9Q557 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DspE9Q557 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DspE9Q557 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DspE9Q557 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DspE9Q557 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DspE9Q557 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms