Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nup153E9Q3G8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Nup153E9Q3G8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Nup153E9Q3G8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nup153E9Q3G8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nup153E9Q3G8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup153E9Q3G8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup153E9Q3G8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup153E9Q3G8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup153E9Q3G8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup153E9Q3G8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup153E9Q3G8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Nup153E9Q3G8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nup153E9Q3G8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nup153E9Q3G8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nup153E9Q3G8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Nup153E9Q3G8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nup153E9Q3G8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nup153E9Q3G8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms