Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Soga1E1U8D0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Soga1E1U8D0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Soga1E1U8D0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.07■■■■■ 4
Soga1E1U8D0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Soga1E1U8D0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Soga1E1U8D0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Soga1E1U8D0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Soga1E1U8D0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Soga1E1U8D0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Soga1E1U8D0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Soga1E1U8D0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Soga1E1U8D0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Soga1E1U8D0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Soga1E1U8D0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Soga1E1U8D0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Soga1E1U8D0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Soga1E1U8D0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Soga1E1U8D0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Soga1E1U8D0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Soga1E1U8D0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Soga1E1U8D0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Soga1E1U8D0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Soga1E1U8D0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Soga1E1U8D0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Soga1E1U8D0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Soga1E1U8D0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Soga1E1U8D0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Soga1E1U8D0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Soga1E1U8D0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Soga1E1U8D0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Soga1E1U8D0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms