Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930467E23RikD3Z1P8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930467E23RikD3Z1P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930467E23RikD3Z1P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms