Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
4930467E23RikD3Z1P8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930467E23RikD3Z1P8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930467E23RikD3Z1P8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4930467E23RikD3Z1P8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930467E23RikD3Z1P8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930467E23RikD3Z1P8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930467E23RikD3Z1P8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930467E23RikD3Z1P8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4930467E23RikD3Z1P8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930467E23RikD3Z1P8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930467E23RikD3Z1P8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930467E23RikD3Z1P8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930467E23RikD3Z1P8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930467E23RikD3Z1P8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930467E23RikD3Z1P8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930467E23RikD3Z1P8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930467E23RikD3Z1P8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930467E23RikD3Z1P8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930467E23RikD3Z1P8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930467E23RikD3Z1P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930467E23RikD3Z1P8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4930467E23RikD3Z1P8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930467E23RikD3Z1P8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
4930467E23RikD3Z1P8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930467E23RikD3Z1P8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930467E23RikD3Z1P8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930467E23RikD3Z1P8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930467E23RikD3Z1P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930467E23RikD3Z1P8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930467E23RikD3Z1P8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930467E23RikD3Z1P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930467E23RikD3Z1P8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930467E23RikD3Z1P8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930467E23RikD3Z1P8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930467E23RikD3Z1P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930467E23RikD3Z1P8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4930467E23RikD3Z1P8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930467E23RikD3Z1P8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930467E23RikD3Z1P8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930467E23RikD3Z1P8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930467E23RikD3Z1P8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930467E23RikD3Z1P8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930467E23RikD3Z1P8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930467E23RikD3Z1P8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930467E23RikD3Z1P8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930467E23RikD3Z1P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930467E23RikD3Z1P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930467E23RikD3Z1P8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930467E23RikD3Z1P8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930467E23RikD3Z1P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930467E23RikD3Z1P8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930467E23RikD3Z1P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930467E23RikD3Z1P8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930467E23RikD3Z1P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930467E23RikD3Z1P8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930467E23RikD3Z1P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930467E23RikD3Z1P8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930467E23RikD3Z1P8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930467E23RikD3Z1P8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4930467E23RikD3Z1P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930467E23RikD3Z1P8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4930467E23RikD3Z1P8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms