Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hbb-bh2B2RVB7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hbb-bh2B2RVB7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hbb-bh2B2RVB7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hbb-bh2B2RVB7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hbb-bh2B2RVB7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hbb-bh2B2RVB7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hbb-bh2B2RVB7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms