Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hbb-bh2B2RVB7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hbb-bh2B2RVB7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hbb-bh2B2RVB7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hbb-bh2B2RVB7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hbb-bh2B2RVB7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hbb-bh2B2RVB7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hbb-bh2B2RVB7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hbb-bh2B2RVB7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hbb-bh2B2RVB7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hbb-bh2B2RVB7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hbb-bh2B2RVB7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hbb-bh2B2RVB7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hbb-bh2B2RVB7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hbb-bh2B2RVB7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hbb-bh2B2RVB7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hbb-bh2B2RVB7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hbb-bh2B2RVB7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hbb-bh2B2RVB7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hbb-bh2B2RVB7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hbb-bh2B2RVB7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hbb-bh2B2RVB7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hbb-bh2B2RVB7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hbb-bh2B2RVB7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hbb-bh2B2RVB7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hbb-bh2B2RVB7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hbb-bh2B2RVB7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hbb-bh2B2RVB7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hbb-bh2B2RVB7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hbb-bh2B2RVB7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hbb-bh2B2RVB7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hbb-bh2B2RVB7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hbb-bh2B2RVB7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hbb-bh2B2RVB7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbb-bh2B2RVB7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hbb-bh2B2RVB7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hbb-bh2B2RVB7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hbb-bh2B2RVB7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbb-bh2B2RVB7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbb-bh2B2RVB7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hbb-bh2B2RVB7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hbb-bh2B2RVB7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hbb-bh2B2RVB7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hbb-bh2B2RVB7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hbb-bh2B2RVB7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hbb-bh2B2RVB7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hbb-bh2B2RVB7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hbb-bh2B2RVB7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hbb-bh2B2RVB7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hbb-bh2B2RVB7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hbb-bh2B2RVB7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hbb-bh2B2RVB7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hbb-bh2B2RVB7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hbb-bh2B2RVB7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hbb-bh2B2RVB7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hbb-bh2B2RVB7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hbb-bh2B2RVB7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hbb-bh2B2RVB7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hbb-bh2B2RVB7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms