Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brpf1B2RRD7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Brpf1B2RRD7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Brpf1B2RRD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Brpf1B2RRD7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Brpf1B2RRD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Brpf1B2RRD7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Brpf1B2RRD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Brpf1B2RRD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Brpf1B2RRD7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Brpf1B2RRD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms