Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp40B1B1D3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp40B1B1D3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp40B1B1D3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp40B1B1D3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp40B1B1D3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp40B1B1D3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp40B1B1D3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp40B1B1D3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp40B1B1D3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp40B1B1D3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp40B1B1D3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp40B1B1D3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp40B1B1D3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp40B1B1D3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp40B1B1D3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp40B1B1D3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms