Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SktA2AQ25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SktA2AQ25 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SktA2AQ25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SktA2AQ25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SktA2AQ25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SktA2AQ25 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SktA2AQ25 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SktA2AQ25 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms