Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms